A MCR-t a mostani frontember Gerard Way, és az ex-dobos Matt "Otter" Pelissier alapította 2001 szeptemberében, kb egy héttel a World Trade Center megtámadása után. Gerard látta a repülőket amikor belecsapódtak a WTC-be és ekkor jött rá, hogy valami hasznosat is kéne tennie az életében, ezért alapított egy bandát.

(Nagy hatással voltak rájuk a kezdetekben a The Misfits, Morrissey, The Smiths és az Iron Maiden is. Eközben megtalálták a saját stílusukat is, ez a horror és a fantasy keveréke, amely a dalszövegeikben, a klipjeikben és a cd-borítójukon is visszaköszön. Az utolsó album borítója is a Gerard Way-től van, (énekes) aki a zenekar előtt képregény rajzoló volt.)

Az első számuk a Skylines and Turnstyles volt,  amit Gerard a szeptember 11-éről való érzéseiről írt. Röviddel ezután, felkérték Ray toro-t, hogy csatlakozzon a bandába, mert Gerard nem tudott gitározni éneklés közben.

Az első számaikat Matt padlásán vették fel, ezek voltak az our Lady of Sorrows (később Bring More Knives) és a Cubicles. Ez Mikey-nak annyira tetszett, hogy elhatározta hogy megtanul gitározni, és beáll a bandába. innentől kezdve rengeteg fellépést vállaltak különböző presszókban.

Ezek után szerződést kötöttek az Eyeball Records-al. Itt játszott a Prencey Prep és a thursday is, és itt ismerték meg Frank Lero-t is, aki a Pensey Prep frontembere és gitárosa is volt. Miután ez a csapat felbomlott (2001, vagy 2002) Frank gitárosként csatlakozot a bandába, néhány nappal azelőtt, hogy a debütáló albumuk megjelent.

Mindössze 3 hónappal a debütáló album megjelenése után, a MCR szerződést bontott az Eyeball Records-al.

Fő karrier:

2003-ban a banda aláírt egy szerződést a Reprise Records-al. A következő turné, az Avenged Sevenfold után elkezdék felvenni a második lemezüket.